Je třeba rozlišovat, zda se jedná o odměnu za činnost jednatele vyplývající z manažerské smlouvy, resp. ze smlouvy o výkonu funkce ve smyslu § 66 ObchZ anebo o podíly na zisku s. r. o. V prvém případě se jedná o provozní náklady běžného účetního období, za které daná odměna náleží. Což souvisí se základním účetním principem časové a věcné souvislosti nákladů a výnosů k příslušnému účetnímu období (tzv. akruální princip). Proto je nutné, aby odměna jednatele za práci pro firmu např. za rok 2011 byla součástí nákladů právě za toto účetní období roku 2011. Není již tolik podstatné, že bude vyplacena až v následujícím účetním období. Tato zásada jasně vyplývá z § 3 odst. 1 zákona č. 563/1991 Sb., o účetnictví, ve znění p. p.
Přitom není překážkou ani určitá míra nejistoty ohledně výše odměny. Pokud ke konci daného účetního období není přesně známá výše odměny jednatele, pak je podle mne namístě využít pasivní dohadný účet. Předmětný závazek vůči jednateli za práci totiž nelze zaúčtovat jako běžný dluh (rovnou na účet 366) a jeho výše není ještě známá (tudíž nelze využít ani účet výdajů příštích období č. 383). Přitom se musí jednat o náklad (na účet 522) právě účetního období, za které odměna náleží, protože s ním jednoznačně věcně a časově souvisí. V tomto směru se podle mne nic zásadního v účetních předpisech nezměnilo. Viz zejména § 17 odst. 7 a § 18 odst. 1 a 2 vyhlášky č. 500/2002 Sb., provádějící zákon o účetnictví pro podnikatele, ve znění p. p., a rovněž Český účetní standard pro podnikatele č. 017 – Zúčtovací vztahy, bod 3.11.7. Interní účetní metodiku je sice obecně vhodné a v některých případech dokonce nutné stanovit ve firemní směrnici (například ohledně limitu významnosti u dlouhodobého majetku či oceňování vlastními náklady), ovšem dohadných položek se to výslovně netýká, nicméně je samozřejmě možné i tuto problematiku v interní účetní směrnici uvést.
Pokud se ovšem týká podílu jednatele na zisku s. r. o., pak jde o docela jinou záležitost. Zisk nahospodařený např. za rok 2011 totiž bude zaúčtován a fakticky tedy poprvé vykázán až v následujícím účetním období roku 2012, proto nemůže být rozdělován (ani jednateli) dříve než v tomto roce 2012. Podíly na zisku přiznané jednateli valnou hromadou (společníky) s. r. o. se nebude účtovat do nákladů, ale obdobně jako standardní podíly na zisku společníků se na základě usnesení valné hromady zaúčtuje proti účtu 431 – Výsledek hospodaření ve schvalovacím řízení.